Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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