Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms