Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXO1Q12778 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms