Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF5Q12774 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms