Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDR1Q08345 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDR1Q08345 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDR1Q08345 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DDR1Q08345 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDR1Q08345 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDR1Q08345 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDR1Q08345 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDR1Q08345 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDR1Q08345 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDR1Q08345 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDR1Q08345 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDR1Q08345 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDR1Q08345 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DDR1Q08345 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DDR1Q08345 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DDR1Q08345 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DDR1Q08345 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDR1Q08345 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DDR1Q08345 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DDR1Q08345 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DDR1Q08345 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DDR1Q08345 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DDR1Q08345 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DDR1Q08345 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDR1Q08345 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDR1Q08345 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDR1Q08345 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms