Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms