Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTDSPL2Q05D32 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms