Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms