Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms