Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms