Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ID3Q02535 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ID3Q02535 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ID3Q02535 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ID3Q02535 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ID3Q02535 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ID3Q02535 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ID3Q02535 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ID3Q02535 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ID3Q02535 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ID3Q02535 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ID3Q02535 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ID3Q02535 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ID3Q02535 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ID3Q02535 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms