Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms