Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms