Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms