Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms