Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD1P98174 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD1P98174 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD1P98174 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD1P98174 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD1P98174 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD1P98174 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD1P98174 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD1P98174 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD1P98174 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FGD1P98174 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FGD1P98174 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FGD1P98174 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FGD1P98174 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FGD1P98174 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD1P98174 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FGD1P98174 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FGD1P98174 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FGD1P98174 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FGD1P98174 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FGD1P98174 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FGD1P98174 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FGD1P98174 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FGD1P98174 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FGD1P98174 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FGD1P98174 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FGD1P98174 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FGD1P98174 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FGD1P98174 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FGD1P98174 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FGD1P98174 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FGD1P98174 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FGD1P98174 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms