Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms