Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms