Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VBP1P61758 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VBP1P61758 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VBP1P61758 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms