Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms