Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP9P55211 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP9P55211 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms