Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MANFP55145 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MANFP55145 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MANFP55145 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms