Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNB3P54284 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB3P54284 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms