Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA8P53708 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms