Protein–RNA interactions for Protein: P51151

RAB9A, Ras-related protein Rab-9A, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9AP51151 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB9AP51151 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms