Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms