Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTAP49354 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTAP49354 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTAP49354 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTAP49354 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNTAP49354 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms