Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK8P49336 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK8P49336 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK8P49336 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK8P49336 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK8P49336 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK8P49336 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK8P49336 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK8P49336 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK8P49336 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK8P49336 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK8P49336 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK8P49336 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK8P49336 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK8P49336 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK8P49336 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK8P49336 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK8P49336 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK8P49336 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK8P49336 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK8P49336 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK8P49336 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK8P49336 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK8P49336 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK8P49336 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK8P49336 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK8P49336 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK8P49336 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK8P49336 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK8P49336 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK8P49336 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK8P49336 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK8P49336 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK8P49336 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK8P49336 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK8P49336 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK8P49336 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK8P49336 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK8P49336 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK8P49336 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK8P49336 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK8P49336 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK8P49336 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK8P49336 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK8P49336 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK8P49336 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK8P49336 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK8P49336 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK8P49336 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK8P49336 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK8P49336 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms