Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms