Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI2P48788 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms