Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NESP48681 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NESP48681 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NESP48681 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NESP48681 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NESP48681 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NESP48681 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NESP48681 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NESP48681 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NESP48681 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NESP48681 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NESP48681 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NESP48681 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NESP48681 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NESP48681 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NESP48681 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NESP48681 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NESP48681 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NESP48681 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
NESP48681 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NESP48681 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NESP48681 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NESP48681 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NESP48681 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NESP48681 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NESP48681 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NESP48681 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NESP48681 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NESP48681 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NESP48681 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NESP48681 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NESP48681 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NESP48681 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NESP48681 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NESP48681 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NESP48681 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NESP48681 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NESP48681 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NESP48681 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NESP48681 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NESP48681 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NESP48681 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NESP48681 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NESP48681 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NESP48681 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NESP48681 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NESP48681 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NESP48681 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NESP48681 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NESP48681 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NESP48681 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NESP48681 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NESP48681 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NESP48681 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NESP48681 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NESP48681 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NESP48681 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NESP48681 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NESP48681 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NESP48681 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NESP48681 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NESP48681 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NESP48681 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NESP48681 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NESP48681 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NESP48681 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NESP48681 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NESP48681 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NESP48681 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NESP48681 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NESP48681 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NESP48681 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NESP48681 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NESP48681 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NESP48681 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NESP48681 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NESP48681 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NESP48681 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NESP48681 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NESP48681 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NESP48681 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NESP48681 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NESP48681 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NESP48681 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NESP48681 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NESP48681 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NESP48681 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NESP48681 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NESP48681 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NESP48681 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NESP48681 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NESP48681 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NESP48681 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NESP48681 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NESP48681 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NESP48681 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NESP48681 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NESP48681 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NESP48681 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NESP48681 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms