Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCVRNP35243 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms