Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
OTX2P32243 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms