Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC13P31276 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms