Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLD1P28340 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLD1P28340 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLD1P28340 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
POLD1P28340 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLD1P28340 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLD1P28340 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLD1P28340 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLD1P28340 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLD1P28340 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLD1P28340 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLD1P28340 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLD1P28340 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLD1P28340 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLD1P28340 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLD1P28340 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLD1P28340 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLD1P28340 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLD1P28340 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLD1P28340 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLD1P28340 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLD1P28340 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLD1P28340 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLD1P28340 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLD1P28340 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLD1P28340 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLD1P28340 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLD1P28340 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLD1P28340 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLD1P28340 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLD1P28340 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLD1P28340 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLD1P28340 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLD1P28340 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLD1P28340 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLD1P28340 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLD1P28340 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLD1P28340 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLD1P28340 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLD1P28340 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLD1P28340 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLD1P28340 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLD1P28340 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLD1P28340 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLD1P28340 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLD1P28340 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLD1P28340 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLD1P28340 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLD1P28340 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLD1P28340 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLD1P28340 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLD1P28340 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLD1P28340 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLD1P28340 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLD1P28340 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLD1P28340 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLD1P28340 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLD1P28340 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLD1P28340 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLD1P28340 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLD1P28340 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLD1P28340 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLD1P28340 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms