Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms