Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms