Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT1P21579 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT1P21579 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT1P21579 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT1P21579 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT1P21579 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT1P21579 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT1P21579 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT1P21579 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT1P21579 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT1P21579 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT1P21579 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT1P21579 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT1P21579 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT1P21579 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT1P21579 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT1P21579 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT1P21579 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT1P21579 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT1P21579 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT1P21579 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT1P21579 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT1P21579 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT1P21579 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT1P21579 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT1P21579 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT1P21579 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT1P21579 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT1P21579 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms