Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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