Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TCP1P17987 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCP1P17987 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCP1P17987 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCP1P17987 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCP1P17987 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCP1P17987 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCP1P17987 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCP1P17987 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCP1P17987 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCP1P17987 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCP1P17987 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCP1P17987 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCP1P17987 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCP1P17987 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TCP1P17987 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TCP1P17987 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TCP1P17987 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TCP1P17987 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TCP1P17987 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TCP1P17987 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TCP1P17987 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TCP1P17987 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCP1P17987 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TCP1P17987 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCP1P17987 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TCP1P17987 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCP1P17987 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCP1P17987 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCP1P17987 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms