Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSPP15924 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSPP15924 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms