Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VAV1P15498 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAV1P15498 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAV1P15498 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms