Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms