Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms