Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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PKHD1P08F94 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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PKHD1P08F94 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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PKHD1P08F94 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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