Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms