Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL18O94889 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms