Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F6O75461 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
E2F6O75461 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
E2F6O75461 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms