Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GMDSO60547 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GMDSO60547 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GMDSO60547 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GMDSO60547 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GMDSO60547 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GMDSO60547 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GMDSO60547 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GMDSO60547 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GMDSO60547 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GMDSO60547 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GMDSO60547 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
GMDSO60547 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMDSO60547 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMDSO60547 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms