Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms